Ministerstvo zemědělství vynaložilo v letech 2017 až 2025 celkem 3,3 miliardy korun na podporu aplikovaného výzkumu v zemědělství. Nedokáže ale vyhodnotit, jestli mají podpořené projekty skutečné dopady v praxi a jaké tyto dopady jsou. Zjistil to Nejvyšší kontrolní úřad (NKÚ) při kontrole peněz vynakládaných ministerstvem na podporu aplikovaného výzkumu. Kontrolní úřad doporučuje změnit systém podpory tak, aby výsledky projektů prokazatelně sloužily zemědělské praxi, stojí ve zprávě NKÚ. Resort se závěry kontroly nesouhlasí.